像在中国一样，在拉丁美洲，基督教也是伴随着西方列强的枪炮和贪婪的殖民者一起进去的。虽然同时进来，但他们仍然壁垒分明。宣教士是因着爱和信仰渴望把福音带给被殖民者看作animal的土著，把他们Christianized。而西班牙和葡萄牙的殖民者，虽然名义上说自己是天主教徒，但骨子里却是贪婪残酷的撒旦之子；他们通过在欧洲要挟教皇的权力来逼迫天主教放弃拦阻他们对印第安人的屠杀和侵略。最后虽然以教皇为代表的教会妥协了，把无辜的印第安人交给殖民者，但在土著里传教的修士们却违背教会这个自称为“上帝在人间的代理人”，留下来和土著一起面对欧洲殖民者的枪炮，不过有的修士选择了暴力还击，有的修士选择举着十字架走向殖民者的枪炮。看着一个修士带领手无寸铁的印第安人走向来犯的殖民者，一个个倒在血泊里，那种从信仰而来的力量超越了暴力。

电影也含蓄地讽刺了天主教官方对殖民势力的妥协，在欧洲教皇为了抱住在各个国家的势力范围，就不得不在印第安人的事情上妥协，把印第安人的利益交给殖民者，自认为是为了保全整体割掉一部分，但通过妥协信仰的原则换来的安定会持久么？印第安人的利益成了宗教权利和世俗权利较量的筹码。

这部电影不仅告诉我们欧洲不代表基督教，而且也告诉我们教皇教宗和主教这一整套天主教的官僚体系不能代表Christinianty,更不能等同上帝。所以在孟度沙祈求神父赐福给他的时候，立志顺服教会权柄的神父虽然拒绝给他祝福，但说了一句发人深省的话：“如果你做的是对的，上帝一定会赐福。如果不对，我的祝福也没意义。”这句话已经撼动了天主教作为上帝人间全权代理人的地位。