毋庸置疑，巨人想讨论的主题内核是“自由”。而自由在剧中人物身上分别有着不同的呈现。以艾伦和阿尔敏为例：

艾伦追求的自由一直是否定的自由，是对绝对力量的崇尚。强盗要害三笠，我就先把强盗杀了；巨人要吃掉人类，我就要驱逐所有巨人；世界仇视帕岛，我就要毁掉这个世界。超大巨毁掉城墙的时候，艾伦把一切原因归结为是我们人类太弱小了。如果我能变强大的话，就可以有否定一切对立面的力量。

而看海的自由是阿尔敏的自由观。当阿尔敏和艾伦分享自己的想法时艾伦觉得阿尔敏很特别，而这种特别是自己从来所没有的。比起阿尔敏所具有的这种精神追求，艾伦觉得自己好像一直很普通。因此艾伦非常羡慕阿尔敏。也因为这种羡慕之情，他把走出城墙，去看海的自由也当做了自己的自由。但实际上这从来不属于艾伦的自我意志。

所以当他发现海的那边还有人类时，当他发现世界超出了自己的认知时，他再次感受到了那种通过否定一切来实现自由的自我意志。谏山创在这里已经暗示了两个人截然不同的自由观，也为终局里二人的对立埋下了伏笔。

回看故事的开始，你会发现一切因果早在最初就埋下了种子。这正是我认为谏山创非常了不起的地方。在长达十几年的连载中，每一个情节、每一句台词、每一处画面都是精心设计，环环相扣到最后。发动地鸣之后，通篇追求着自由的艾伦成了最不自由的人。数千年的种族仇恨、文化冲突、利益争夺，艾伦只是被历史必然性推着前行的一个载体，遵循着因果链条完成灭世（战争）的进程。作为链条上的一环，艾伦从没有拥有过真正的自由——主动选择的自由。

最后，故事的结尾落在了艾伦死去和复生的怪诞虫之上，暗示历史的再一次循环。谏山创对自由的探讨的野心远比我们想象得要大。自由不能仅限于个人，自由不但是自己的自由，也是全体的自由。正如萨特所说：“如果人们不着重他人的自由，那么，一段时间表现在他们之中的自由就会立即被摧毁。”

因此谏山创真正想传达的是：仅凭杀戮一切的绝对力量就能带来自由吗？在历史无限的循环中，人类文明又是否存在摆脱必然性和自身局限性，拥有选择真正的自由的可能？这才是这部神作真正用意所在。